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Nützliches, Tips & Tricks (VnmrJ Software, Linux)

Pulssequenzen:
Doppelt (H,C) bandselektives bsEXSIDE
CPMG-HSQMBC
COLOC-S

Interface:
Verbesserte "More 1D" und "More 2D" Panels

Linux Tips & Tricks
Aufsetzen eines SAMBA-Servers
top-Kommando


Doppelt (H,C) bandselektive bsEXSIDE Pulssequenz

One problem of the standard, default EXSIDE pulse sequence (which is used to measure nJCH coupling constants) is its long measurement time, as a very high resolution is required in F1 to adequately measure the small couplings (typically ni > 600). At the same time, only very few coupling can be measured simultaneously (by exciting multiple protons), as these protons may not be mutually coupled by JHH couplings.
To alleviate this, a bsEXSIDE was created that adds a band-selectivity in F1, thus dramatically reducing the number of increments required. Typically only a single nJCH is measured with this experiment.

Originalveröffentlichung: SelEXSIDE: fast and easy measurement of multiple-bond 1H,13C coupling constants for stereochemical analysis

Das herunterzuladende Paket ist ein Appdir und beinhaltet Pulssequenz, Parameter, Chempack/VnmrJ3+ kompatible Panels, Setup-Makros und ein Experiment Selector Knopf.

Installation: Kopieren Sie das File auf Ihr NMR-System und entpacken Sie es mittels
      tar zxf bsEXSIDE.tgz
Dann aktivieren Sie das resultierende bsEXSIDE Verzeichnis als Appdir unter Edit → Applications.

Download bsEXSIDE.tgz

CPMG-HSQMBC Pulssequenz

This is an HSQMBC pulse sequence to measure long-range nJCH coupling constants.

Originalveröffentlichung : One- and two-dimensional gradient-selected HSQMBC NMR experiments for the efficient analysis of long-range heteronuclear coupling constants

Das herunterzuladende Paket ist ein Appdir und beinhaltet Pulssequenz, Parameter, Chempack/VnmrJ3+ kompatible Panels, Setup-Makros und ein Experiment Selector Knopf.

Installation: Kopieren Sie das File auf Ihr NMR-System und entpacken Sie es mittels
      tar zxf CPMGHSQMBC.tgz
Dann aktivieren Sie das resultierende CPMGHSQMBC Verzeichnis als Appdir unter Edit → Applications.

Download CPMGHSQMBC.tgz

COLOC-S Pulssequenz

This is a 13C detected COLOC-S experiment that is considerably old but can still have its uses:
When running in undecoupled fashion, one can use it to determine long-range CH coupling constants for signals that otherwise would overlap in the 1H dimension (EXSIDE/bsEXSIDE or HSQMBC may not help here if overlap is too bad). With the resolving power of 13C this may be one way out (albeit it's a very unsensitive experiment of course). The minimum phase cycle of this slightly modified version is 4 (original paper: 16).

Originalveröffentlichung : COLOC-S: A modified COLOC sequence for selective long-range X-H correlation 2D NMR spectroscopy

The attached package is an appdir and contains pulse sequence, parameters, Chempack/VnmrJ3+ compatible panels, setup macros and an Experiment Selector button.

Installation: copy the file anywhere and unpack with
      tar zxf COLOC.tgz
Then activate the resulting COLOC directory as an appdir under Edit → Applications.

Download COLOC.tgz


Verbesserte "More 1D" und "More 2D" Panels (verbesserte Lösungsmittelsubtraktion)

These panels (Chempack/VnmrJ3+ compatible) provide the following additions:
  • 1D: Auswahl zwischen Hz & ppm für Lösungsmittelsubtraktion
  • 2D: Auswahl zwischen Lösungsmittelsubtraktion in F2 und F1 (fehlende Parameter werden automatisch erzeugt)
  • 2D: Auswahl zwischen Hz & ppm für Lösungsmittelsubtraktion
  • 2D: "set" Knopf wie für 1Ds

Installation: Kopieren Sie das File in Ihr lokales vnmrsys-Verzeichnusund entpacken Sie es mittels
      tar zxf More1D2D.tgz
Starten Sie VnmrJ neu.

Download More1D2D.tgz